劉如娟      助理教授、研究員

所在學院

生命科學與技術學院

研究方向

RNA修飾/tRNA生物學

聯系方式

liurj@@shanghaitech.edu.cn




個人簡介



2003年本科畢業于安徽大學;2009年博士畢業于中國科學技術大學;2009年至2019年在中科院生物化學與細胞生物學研究所先后任助理研究員、副研究員、研究員;期間,先后在歐洲分子生物學實驗室(EMBL)和芝加哥大學進行訪學研究。20197月加入上??萍即髮W生命科學與技術學院任助理教授、研究員。



主要研究內容



RNA在生命過程中發揮關鍵作用?;瘜W修飾使RNA由標準的A、G、C、U四種堿基擴展到130余種修飾堿基,大大增加了RNA的復雜性和調控性。細胞內含修飾類型最多、修飾最密集的RNA是一類叫tRNA的分子。tRNAFransis Crick提出的“adaptor hypothesis”中的主角,它作為連接氨基酸與mRNA之間的接頭分子參與細胞內蛋白質合成保證了遺傳信息的精確傳遞。盡管其經典功能已被發現數十年,然而,由于研究技術手段的限制,tRNA領域內很多重大的核心科學問題長期懸而未決,如tRNA上百余種化學修飾存在的意義究竟是什么?這些修飾是如何被加上和去除的?tRNA動態修飾如何受到外界環境的調控?近年來,越來越多的tRNA非蛋白質合成功能陸續被發現,它們參與生命活動的方方面面,因此tRNA以及由其產生的小調控RNAtsRNA, tRF, etc.)再次成為生物醫學領域的明星分子被廣泛關注。tRNA修飾由RNA修飾酶介導,其動態修飾水平受修飾酶和去修飾酶的共同調控;tRNA修飾缺陷與多種人類疾病直接相關,特別是神經發育/退化疾病和代謝疾病,然而人們對于tRNA修飾的機制以及由修飾缺陷所引起的復雜表型的機理知之甚少。

本實驗室綜合運用生物化學、生物物理和細胞生物學中常規研究手段結合定量質譜以及tRNA高通量測序等實驗方法研究tRNA生物學中關鍵的科學問題,試圖去理解細胞內由眾多化學修飾以及大量tRNA基因所構成的復雜的tRNA世界,特別關注tRNA動態修飾的分子機制、調控、以及其對tRNA發揮經典和非經典功能的作用,擬闡明tRNA修飾缺陷導致人類疾病的分子機制。



代表性論文



在相關領域已發表研究論文20篇,其中13篇為(共同)第一和/或通訊作者(*,通訊作者;#,第一作者):

1.Jing   Li, Hao Li, Tao Long, Han Dong, En-Duo Wang* and Ru-Juan Liu*   (2019) Archaeal NSUN6 catalyzes m5C72   modification on a wide-range of specific tRNAs.Nucleic Acids Res. 47 (4), 2041-55.   

2.Ru-Juan Liu#*,   Tao   Long#Jing Li,Hao Li,En-Duo Wang*2017Structural basis   for substrate binding and catalytic mechanism of a human RNA:m5C   methyltransferase NSun6.Nucleic   Acids Res. 45 (11), 6684-97. 

3.Tao   Long, Jing Li, Hao Li, Mi Zhou, Xiao-Long Zhou, Ru-Juan Liu*, and En-Duo Wang* (2016Sequence-specific   and Shape-selective RNA Recognition by the Human RNA 5-Methylcytosine   Methyltransferase NSun6.J   Biol Chem.291(46), 24293-303. 

4.Mi   Zhou, Tao Long, Zhi-Peng Fang, Xiao-Long Zhou, Ru-JuanLiu*, En-Duo   Wang* (2015Identification   of determinants for tRNA substrate recognition by Escherichia coli C/U34   2'-O-methyltransferase.RNA Biol. 12(8), 900-11.

5.Ru-Juan Liu#, Tao Long#, Mi Zhou,   Xiao-Long Zhou, En-Duo Wang* (2015)   tRNA recognition by a bacterial tRNA Xm32   modification enzyme from the SPOUT methyltransferase superfamily.Nucleic Acids Res. 43(15), 7489-503.

6.Ru-Juan Liu#,   Mi Zhou#, Zhi-Peng Fang, Meng Wang, Xiao-Long Zhou and En-Duo Wang(2013) The tRNA recognition mechanism of   the minimalist SPOUT methyltransferase, TrmL. Nucleic Acids Res.41(16),   7828-42.


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