趙素文    助理教授、研究員
所在學院生命科學與技術學院
iHuman研究所
研究方向計算生物學
聯系方式zhaosw@@shanghaitech.edu.cn
 

 個人簡介 
2004年獲得中國科學技術大學高分子物理專業學士學位(導師:郭慶祥)。2009年獲得美國哥倫比亞大學化學專業博士學位(導師:Richard A. Friesner)。2010-2014 在美國加州大學舊金山分校藥物化學系做博士后(導師:Matthew P. Jacobson)。2014年加入上??萍即髮WiHuman研究所任研究副教授、研究員,加入上??萍即髮W生命科學與技術學院任助理教授。
 主要研究內容 

GPCR全長結構預測;GPCR和其它細胞信號傳導通路蛋白的配體預測。

實驗室主頁:zhaolab.shanghaitech.edu.cn

 代表性論文 
[1] S. Zhao, R. Kumar, A. Sakai, M. W. Vetting, B. M. Wood, S. Brown, J. B. Bonanno, B. S. Hillerich, R. D. Seidel, P. C. Babbitt, S. C. Almo, J. V. Sweedler, J. A. Gerlt, J. E. Cronan, and M. P. Jacobson, “Discovery of new enzymes and metabolic pathways by using structure and genome context”, Nature, 502, 698-702 (2013).
[2] S. Zhao, A. Sakai, X. Zhang, M. W. Vetting, R. Kumar, B. Hillerich, B. San Francisco, J. Solbiati, A. Steves, S. Brown, E. Akiva, A. Barber, R. D. Seidel, P. C. Babbitt, S. C. Almo, J. A. Gerlt and M. P. Jacobson, “Prediction and characterization of enzymatic activities guided by sequence similarity and genome neighborhood networks”, eLife, e03275 (2014).
[3] M. P. Jacobson, C. Kalyanaraman, S. Zhao and B. Tian, “Leveraging structure for enzyme function prediction: methods, opportunities, and challenges”, Trends Biochem. Sci.,39(8), 363-71 (2014).
[4] R. Kumar, S. Zhao, A. Sakai, M. W. Vetting, B. M. Wood, S. C. Almo, J. V. Sweedler, J. A. Gerlt, J. E. Cronan, and M. P. Jacobson, “Prediction and biochemical demonstration of a catabolic pathway for the osmoprotectant, proline betaine”, mBio,5, (2014).
[5] S. Zhao, K. Zhu, J. Li, R. A. Friesner, “Progress in super long loop prediction”, Proteins, 79, 2920-2935 (2011).                                    

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